Imagen médica — reducción de ruido en resonancia magnética y expresión génica a partir de patología

De un vistazo

• El ruido speckle oculta el detalle diagnóstico en la resonancia magnética; los ensayos de expresión génica son lentos y costosos, mientras que las imágenes de patología son rápidas y baratas.
• Modelos de eliminación del ruido speckle para resonancia magnética, y una tesis que predice la expresión génica a partir de imágenes de patología de gigapíxeles.
• Completado: proyecto de resonancia magnética de 2020 a 2021; tesis de máster terminada en septiembre de 2025, con un artículo en preparación.

Aspectos destacados

• Reducción del ruido speckle en resonancia magnética

  Modelos de eliminación de ruido dirigidos al ruido speckle, que destruye el detalle diagnóstico en la resonancia magnética y en modalidades afines.

• Expresión génica a partir de imágenes de patología

  La tesis pone a prueba si las imágenes de lámina completa de patología pueden sustituir a un ensayo de expresión génica lento y costoso.

• Modelos fundacionales de visión

  Un modelo fundacional de visión procesa la imagen de lámina completa, de gigapíxeles, como primer paso de la línea de patología.

• Redes neuronales de grafos

  Una red neuronal de grafos trabaja sobre la salida del modelo de visión en el camino hacia la predicción de la expresión génica.

• Técnicas adaptadas de los modelos de lenguaje

  Técnicas procedentes de los grandes modelos de lenguaje, adaptadas a esta tarea y combinadas con métodos estadísticos y probabilísticos.

• Objetivo: cómputo y latencia bajos

  La tesis buscó mantener el procesamiento y la latencia lo más bajos posible, una restricción estricta con entradas de gigapíxeles.

El reto

El ruido speckle destruye el detalle diagnóstico en la resonancia magnética. El primer proyecto se propuso reducirlo, en resonancia magnética y en modalidades de imagen afines.

El segundo problema es tanto económico como científico. Los ensayos de expresión génica son lentos, caros y complicados desde el punto de vista logístico, mientras que las imágenes de lámina completa de patología se obtienen de forma rápida y barata. Esas imágenes tienen escala de gigapíxeles, y la tesis se impuso una restricción estricta de cómputo y latencia.

Arquitectura

Dos líneas de investigación. Para la resonancia magnética, modelos de eliminación del ruido speckle. Para la patología, un modelo fundacional de visión procesa la imagen de lámina completa y una red neuronal de grafos trabaja sobre su salida, mientras que técnicas de grandes modelos de lenguaje adaptadas a la tarea también alimentan la predicción de la expresión génica. El enfoque utiliza además métodos estadísticos y probabilísticos.

Lo que construí

La tesis se pregunta si las imágenes de lámina completa de patología pueden sustituir a un ensayo de expresión génica. Busca recuperar la señal de biología molecular directamente a partir de imágenes de gigapíxeles, manteniendo a la vez el procesamiento y la latencia lo más bajos posible.

• Resonancia magnética: reducción del ruido speckle en resonancia magnética y en modalidades de imagen afines.

• Patología: predicción de la expresión génica a partir de imágenes de patología digital, combinando redes neuronales de grafos, modelos fundacionales de visión, técnicas adaptadas de los LLM y modelado estadístico.

Resultado

La tesis de máster se completó en septiembre de 2025 en la Universidad Tecnológica de Isfahán, y hay en preparación un artículo basado en ella. El proyecto sobre ruido speckle en resonancia magnética para una empresa privada se desarrolló de marzo de 2020 a marzo de 2021.

Mi papel

• Investigó la reducción del ruido speckle en resonancia magnética y en modalidades de imagen afines para una empresa privada, de marzo de 2020 a marzo de 2021.
• Escribió una tesis de máster en la Universidad Tecnológica de Isfahán sobre la predicción de la expresión génica a partir de imágenes de patología digital.
• Combinó en el enfoque de la tesis redes neuronales de grafos, modelos fundacionales de visión, técnicas adaptadas de los LLM y métodos estadísticos.
• Trabajó en la tesis bajo una restricción estricta de cómputo y latencia.

Ingeniería

• El cómputo y la latencia como restricciones

  La tesis se desarrolló bajo una restricción estricta de cómputo y latencia, con el objetivo de mantener ambos lo más bajos posible.

• Diseñado para entradas de gigapíxeles

  La línea de patología trabaja directamente sobre imágenes de lámina completa de gigapíxeles.

• Varias familias de modelos, una sola predicción

  Los métodos de grafos, los modelos fundacionales de visión y las técnicas adaptadas de modelos de lenguaje alimentan una única predicción de la expresión génica, junto con métodos estadísticos.

Resultados

• Tesis de máster completada en septiembre de 2025 en la Universidad Tecnológica de Isfahán; hay un artículo en preparación.
• Proyecto de reducción del ruido speckle en resonancia magnética completado para una empresa privada, de marzo de 2020 a marzo de 2021.
• Tesis: predicción de la expresión génica (biología molecular) a partir de imágenes de patología digital.